Los php_flag son parámetros de seguridad que habitualmente se configuran desde el php.ini para todo el servidor o desde el .htaccess para una aplicación en particular. En caso de tener PHP instalado como un módulo de apache podrás configurar los php_flag desde el .htaccess de la siguiente manera:

php_flag magic_quotes_gpc Off
php_flag safe_mode on
php_flag expose_php off
php_flag display_errors off

En cambio, si tu instalación PHP corre como CGI esta forma sólo hará que tu web muestre un error interno del servidor. Para evitar esto podemos crear un php.ini para la aplicación web. Es tan sencillo como crear un archivo de texto con el nombre 'php.ini' en el directorio raíz de la web e introducir los flags que necesitas, como puedes observar en el siguiente ejemplo:

magic_quotes_gpc = Off
display_errors = Off
register_globals = Off